經顱多普勒血流分析儀檢查通常耗時不長，一般在十幾分鐘左右，具體時間會因檢測血管數量和信號獲取情況有所差異。檢查過程中只是將探頭放置在頭部特定位置，不需要注射或服藥，多數人不會感到明顯不適。部分人可能會感覺探頭按壓，但屬于正常現象。檢查結束后可以正常活動，不影響日常生活，因此在體檢和隨訪中使用較為方便。